衛生許可證，是指單位和個人從事食品生產及餐飲店的經營活動，經衛生行政部門審查批準后，發給的衛生許可憑證，有注冊備案的許可證號。
根據2005年12月衛生部印發的《食品衛生許可證管理辦法》，“任何單位和個人從事食品生產經營活動，應當向衛生行政部門申報，并按照規定辦理衛生許可證申請手續；經衛生行政部門審查批準后方可從事食品生產經營活動，并承擔食品生產經營的食品衛生責任。”
辦理程序
一、 辦證順序：
申報圖紙（同時準備所需材料）審查圖紙及相關材料 現場驗收 合格后申報材料
10個工作日領取衛生許可證
二、 申辦衛生許可證所需申報材料：
1、 生產經營場所地平面布局圖一份，應標明比例尺（比例為1：100）、室內各功能房，基本要素（尺寸、名稱、設施名稱及個數），可自行手繪或用電腦繪制；
2、 生產經營場地場所的使用證明（房屋產權證明和租賃協議）；
3、 法定代表人或者負責人資格證明（董事會決議、章程或任命文件）一份；
4、 生產經營場所地址方位示意圖一份：應標明方向、街道名稱、生產經營場所所在位置與周圍建筑、相鄰單位的關系；
5、 法人或負責人培訓證明；
6、 產品配方、生產工藝流程圖和說明，產品包裝材料、標簽、說明書樣稿；
7、 產品或試產樣品衛生檢驗報告（在區縣及以上衛生行政部門取得的當年度檢測報告）和產品執行標準（含企業標準）；
8、 企業衛生管理的組織和制度的資料；
9、 實驗室設置情況（包括：實驗室規模、儀器設備、實驗人員資格證明）及可檢測項目（每批次、每天的留校和檢測指標、檢測項目）；
10、 衛生許可證申請書一份：申請單位名稱寫明全稱或法定簡稱，加蓋公章（與營業執照申請單位名稱一致，個人不蓋章），單位地址、使用面積、衛生設施按實際情況填寫詳細，申請許可項目填寫生產經營范圍和種類，空格處以“無”字填寫；
11、 建設項目衛生審查申請書一份：“項目類別”一欄填寫新建、改建、擴建、還是續建，空格處以“無”字填寫；
12、 食品的委托加工還需提交委托加工合同書和受委托加工企業衛生許可證，且受委托企業衛生許可證項目中應含有與委托加工產品相同工藝的新產品；
13、 生產加工學生營養餐的企業還需提供以下資料：
（1） 制定學生營養餐的依據及標準；
（2） 學生營養餐的合理營養配餐資料：學生營養餐的營養素、熱量、蛋白質、脂肪、鈣、鐵、鋅、視黃醇當量、維生素B1、維生素B2、維生素C的設計計算資料，根據營養成分計算的配料資料，根據食物配料編制食譜；
（3） 合理烹調，防止營養素損失的措施；
（4） 保證學生營養餐衛生安全的管理措施及食品留樣制度；
（5） 生產經營學生營養餐的送餐企業應提供企業標準，食品包裝上應標明廠名、廠址、主要營養成分最低含量、裝盒時間、食品時限；
（6） 營養工作人員資料（營養師資格證明）；
14、 申請單位在工商管理局取得的《企業名稱預先核準通知書》復印件或《工商營業執照》（或副本）復印件；
15、 衛生行政部門認為有必要提交的其他資料。